Poradnia rehabilitacyjna w ostatnich latach generowała koszty, które były wyraźnie wyższe niż kontrakt z Narodowym Funduszem Zdrowia. W efekcie szpital musiał do tej sfery usług dopłacać. Zmniejszenie zatrudnienia w poradni jako sposób na rozwiązanie sytuacji, rozważano już wcześniej, ale ze względu na koszty społeczne i negatywne stanowisko związków, tego pomysłu nie wprowadzono w życie. Tym razem podobnych przeszkód nie było. Umowę o pracę z siedmioma osobami rozwiązano na mocy porozumienia stron.
W ocenie dyrekcji szpitala ograniczenie zatrudnienia nie będzie miało dla pacjentów negatywnych skutków. Personel pracować będzie wprawdzie w okrojonym składzie, ale też kontrakt z NFZ na kolejne lata jest wyraźnie niższy.
W Szpitalu Specjalistycznym im. Jędrzeja Śniadeckiego w Nowym Sączu działa 19 oddziałów szpitalnych, w tym SOR i stacja dializ. Niedawno szpital przeprowadził remont pulmonologii oraz neurologii. Kompleksowa diagnostyka jest prowadzona w medycznym laboratorium diagnostycznym oraz dziale diagnostyki obrazowej. Do struktury SP ZOZ należy także przyszpitalna przychodnia, która oferuje porady w ramach 24 specjalności medycznych.
Wartość kontraktu szpitala z NFZ na rok 2011 wynosi obecnie 71 388 236,50 zł. Ubiegłoroczny miał wartość 76 825 807,80 zł.